Handlingen er lagt til 1600-tallet. Jonathan Dymond bor sammen med sine foreldre i landsbyen Spadboro. Familien fremstiller cider. En dag får de et brev fra onkelen, som ønsker å snakke med faren. Da faren kommer tilbake noen dager senere, er alt han vil si at onkelen er død. Jonathan kommer over en bit av onkelens brev i frukthagen. Han bestemmer seg for å løse familiens gåte.
